仿刺参的微卫星标记
为了评价种质资源及基础生物学研究的需要,本文开发了仿刺参的微卫星标记.NCBI数据库中共有20个含有仿刺参微卫星的序列,从中选取8个设计引物,发现6个微卫星位点有多态性.不同的引物获得的等位基因数为3～9个不等,6个位点共获得了31个等位基因,每个位点平均获得5.2个等位基因.6个位点的平均观测杂合度(Ho)为0.3611,平均期望杂合度(He)为0.6402.位点AJMS004提供的多态性信息含量值较低,为0.4862;其他5个位点均在0.5以上.另外,还尝试了红海参(Parastichopus californicus)微卫星标记在仿刺参的通用性.实验结果表明,在较高的退火温度下,5对引物均能扩增仿刺参的基因组DNA并具多态性.5个位点共获得了22个等位基因,每个位点平均获得4.4个等位基因.5个位点的平均观测杂合度(Ho)为0.1733,平均期望杂合度(He)为0.4201.其中位点Psc 2的多态性信息含量值最高,为0.8500.
作 者： 战爱斌 包振民 陆维 汪小龙 胡景杰 ZHAN Ai-bin BAO Zhen-min LU Wei WANG Xiao-long HU Jing-jie 作者单位： 战爱斌,ZHAN Ai-bin(中国海洋大学生命科学与技术学部海洋生物遗传与种质工程实验室,山东,青岛,266003;中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室,山东,青岛,266003)包振民,陆维,汪小龙,胡景杰,BAO Zhen-min,LU Wei,WANG Xiao-long,HU Jing-jie(中国海洋大学生命科学与技术学部海洋生物遗传与种质工程实验室,山东,青岛,266003)
刊 名： 水产学报 ISTIC PKU 英文刊名： JOURNAL OF FISHERIES OF CHINA 年，卷(期)： 2006 30(2) 分类号： S917 关键词： 仿刺参 微卫星标记 多态性 通用性