一株海洋新鞘氨醇杆菌phe-8(Novosphingobium sp.)的PAHs降解基因和降解特性
以菲为唯一碳源和能源从厦门近海海水样品中筛选到一株能够降解多种PAHs的细菌.16S rDNA序列同源性分析表明它可能属于新鞘氨醇杆菌属(Novosphingobium sp.).根据已经报道的PAHs起始双加氧酶大亚基基因序列,设计了一对简并引物,并PCR扩增得到了约700 bp的基因片段.比对结果显示它同已报导的一株降解菌Novosphingobium aromaticivorans F199质粒上的bphA1f基因相似度最高,达到98.26%,该基因编码的蛋白推断是萘或联苯双加氧酶大亚基.以PCR产物为模板制备DNA探针, Southern杂交表明:该基因位于其质粒DNA上.采用气相色谱-质谱联用测定了该菌的降解率,发现它可以高效降解多种高分子量PAHs.
邵宗泽,SHAO Zong-ze(国家海洋局第三海洋研究所,福建,厦门,361005)
刊 名： 厦门大学学报（自然科学版） ISTIC PKU 英文刊名： JOURNAL OF XIAMEN UNIVERSITY (NATURAL SCIENCE) 年，卷(期)： 2006 45(z1) 分类号： Q939 关键词： 新鞘氨醇杆菌 多环芳烃 生物降解 双加氧酶 降解率