三种猫科动物MHC Class Ⅱ DRB等位基因序列变异性分析
分析了云豹(Neofelis nebulosa)、豹(Panthera pardus)和东北虎(Panthera tigris altaica)等3种猫科动物的主要组织相容性复合物ClassⅡDRB座位的等位基因序列变异性.使用一对简并性引物扩增了DRB座位第二外元目标片段.用单链构像多态性分析方法确定不同的单倍型.每个个体挑出15个单克隆用来分离、纯化和测序.实验中从4个个体中获得了8种不同序列.237 bp核苷酸序列中发现有59个变异位点.根据人类的抗原肽结合区推测79个氨基酸位点中存在21个假定的抗原肽结合位点,而且非同义替换率明显高于同义替换率,这可能说明了第二外元的较高变异性是由平衡选择作用来维持的.重建的NJ树和MP树显示豹和东北虎的亲缘关系较近,而两者与云豹的亲缘关系较远.
作 者： 王倩 吴孝兵 晏鹏 WANG Qian WU Xiao-bing YAN Peng 作者单位： 安徽师范大学,生命科学学院,重要生物资源保护与利用安徽省重点实验室,安徽,芜湖,241000 刊 名： 动物学研究 ISTIC PKU 英文刊名： ZOOLOGICAL RESEARCH 年，卷(期)： 2006 27(2) 分类号： Q959.838 Q959.838.03 关键词： MHC基因 DRB座位 第二外元 猫科动物 变异性