蛋白质组研究中离子阱串联质谱数据搜库结果解释方法
基于离子阱串联质谱仪的鸟枪法是一种高通量的蛋白质鉴定方法.得到的数据一般使用软件SE-QUEST搜索蛋白质序列数据库,得到肽段鉴定列表以及相应的打分.为了得到蛋白质鉴定列表,还需要进行肽段鉴定结果的过滤和假阳性率的计算,然后根据肽段鉴定结果组装蛋白质列表.这两个问题目前还没有很好地解决.对已有的方法进行总结和比较,可以给搜库结果解释方法的选择提供参考,对数据质量控制方法的改进也有所帮助.
朱云平,贺福初,ZHU Yun-ping,HE Fu-chu(军事医学科学院放射与辐射医学研究所,北京,100850;北京蛋白质组研究中心,北京,102206)
刊 名： 生物物理学报 ISTIC PKU 英文刊名： ACTA BIOPHYSICA SINICA 年，卷(期)： 2006 22(4) 分类号： Q5 关键词： SEQUEST 离子阱串联质谱 数据质量控制 蛋白质鉴定