基于小波分析的线粒体基因组分形维数提取
结合DNA游走方法和小波分析研究了不同物种的线粒体基因组序列的自相似分形结构,提取了线粒体基因组序列的AT Walk,AG Walk和AC Walk分维数指标.研究结果表明3种游走序列的分维数均大于1,并且在同类物种中的AG Walk的分维数间有一定的关系.证明线粒体基因组序列存在自相似分形结构,这种结构受到ATGC碱基在基因组中的排列结构影响.
作 者： 武伟 刘洪斌 郑昆 鲁成 谢德体 WU Wei LIU Hong-bin ZHENG Kun LU Cheng XIE De-ti 作者单位： 武伟,郑昆,WU Wei,ZHENG Kun(西南大学,农业部蚕桑学重点实验室,重庆,400716;西南大学,计算机与信息科学学院,重庆,400716)刘洪斌,谢德体,LIU Hong-bin,XIE De-ti(西南大学,资源与环境学院,重庆,400716)
鲁成,LU Cheng(西南大学,农业部蚕桑学重点实验室,重庆,400716)
刊 名： 西南农业大学学报（自然科学版） ISTIC PKU 英文刊名： JOURNAL OF SOUTHWEST AGRICULTURAL UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE) 年，卷(期)： 2006 28(5) 分类号： Q94 关键词： 小波分析 DNA游走 线粒体基因组 分形维数