人类群体遗传结构的双标图模型及其应用
提出了分析人类群体遗传结构的PPG双标图模型的基本原理及其应用.PPG双标图根据人类群体遗传学的基本原理,利用矩阵奇异值分解技术,将多维基因频率矩阵近似为一个能够用双标图表示的二维矩阵,从而实现了人类群体遗传结构的图形化和可视化直观分析.它与聚类分析、主成分分析、对应分析等传统多元统计分析方法相比,具有明显的优越性.PPG双标图通过其几何性质,反映了其丰富的群体遗传学含义;更重要的是,在基因频率矩阵前2项奇异值的累计贡献率足够大的前提下,利用双标图,以辅助线为补充,可以实现人类群体遗传结构的可视化直观定量分析:①比较各群体之间的遗传距离,划分群体类型;②比较各基因的变异性大小;③分析各基因之间的相关性;④比较某基因对各亚群体遗传结构的相对贡献;⑤比较任意2个亚群体遗传结构的差异;⑥分析任意2个基因的差异及其对各亚群体变异性的贡献;⑦分析群体与基因的交互作用及其对群体亚分的贡献.因此,PPG双标图值得在人类群体遗传结构分析中推广应用,但PPG双标图也存在一定的局限性.
作 者： 薛付忠 王洁贞 郭亦寿 胡平 XUE Fu-zhong WANG Jie-zhen GUO Yi-shou HU Ping 作者单位： 薛付忠,王洁贞,胡平,XUE Fu-zhong,WANG Jie-zhen,HU Ping(山东大学公共卫生学院流行病学与医学统计学研究所,济南,250012)郭亦寿,GUO Yi-shou(山东大学医学院医学遗传学研究所,济南,250012)
刊 名： 科技导报 ISTIC PKU 英文刊名： SCIENCE & TECHNOLOGY REVIEW 年，卷(期)： 2006 24(5) 分类号： Q347 R394.5 关键词： 人类群体遗传结构 PPG双标图模型 HLA-A基因座 汉族群体