萝芙木异胡豆苷合成酶基因的克隆与分析
以萝芙木叶片为材料,应用RT-PCR方法首次克隆了萝芙木萜类吲哚生物碱(terpenoid indole alkaloids,TIAs)生物合成途径中重要的限速酶--异胡豆苷合成酶(strictosidine synthase,STR)基因(GenBank登录号DQ0170054)并进行了生物信息学分析,以pCAMBIA1304为基本载体构建其植物高效表达载体pCAMBIA1304+-RvSTR.生物信息学分析表明,该基因的编码区长度为1 035 bp,编码344个氨基酸的多肽,其理论分子量为38.2kD,等电点为5.2,N端有一长度为27个氨基酸的信号肽;二级结构预测表明,延伸链和不规则盘绕是RvSTR蛋白最大量的结构元件,而α螺旋和β-转角则散布于整个蛋白质中.同源性分析表明,RvSTR和其它植物来源的STR同源;采用MEGA3构建了具代表性的植物STR的分子系统发育树,首次提出植物来源的STR分为2种类型,即STR1和STR2,其中来源于能够产生TIAs的植物的STR属于STR2类型.
作 者: 王泓 谌容 陈敏 孙敏 廖志华 WANG Hong CHEN Rong CHEN Min SUN Min LIAO Zhi-hua 作者单位: 王泓,谌容,陈敏,WANG Hong,CHEN Rong,CHEN Min(西南大学,生命科学学院,重庆,400715)孙敏,SUN Min(西南大学,生命科学学院,重庆,400715;三峡库区生态环境教育部重点实验室,重庆,400715)
廖志华,LIAO Zhi-hua(西南大学,生命科学学院,重庆,400715;重庆市甘薯研究中心,重庆,400715;三峡库区生态环境教育部重点实验室,重庆,400715)
刊 名: 西北植物学报 ISTIC PKU 英文刊名: ACTA BOTANICA BOREALI-OCCIDENTALIA SINICA 年,卷(期): 2006 26(5) 分类号: Q785 Q949.776.5 关键词: 萝芙木 异胡豆苷合成酶 克隆 生物信息学