北极太平洋扇区海洋沉积物细菌多样性的系统发育分析
对北极太平洋扇区3个不同深度的海洋沉积物样品,采用PCR结合变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术进行细菌16SrRNA基因V3区序列的系统发育分析.结果表明,同一个沉积物样品不同层次的DGGE电泳图谱不完全相同.从3个沉积物样品中共获得50条序列,大部分序列与从海洋环境尤其海洋沉积物获得的细菌16S rDNA序列相似性较高(88%～100%),归属于变形细菌(Proteobacteria)的gamma亚群、alpha亚群、beta亚群、epsilon亚群、delta亚群,Cytophaga-Flavobacterium-Bacteroides(CFB)群细菌和高G+C含量的革兰氏阳性细菌等系统分类群,其中变形细菌(Proteobacteria)的gamma亚群为沉积物中的优势细菌类群.
任大明,REN Da-ming(复旦大学遗传学研究所,遗传工程国家重点实验室,上海,200433)
刊 名： 微生物学报 ISTIC PKU 英文刊名： ACTA MICROBIOLOGICA SINICA 年，卷(期)： 2006 46(2) 分类号： Q938 Q939 关键词： 北极太平洋扇区 沉积物 细菌 系统发育