蛋白质组学研究中的无标记定量方法
蛋白质定量是探索疾病发生发展状况和寻找新药靶标的重要手段.该领域最常用的技术是比较染色后的二维凝胶上蛋白点的光密度值或综合同位素标记后的质谱峰强度方法.但此二者的样品处理方法都比较麻烦,不利于进行大规模蛋白质组的定量研究.最近几年出现了利用质谱数据进行无标记定量的方法,根据数据类型这些方法可以分为2类:基于鉴定蛋白的肽段数的方法和基于质谱峰强度的方法,在高通量大规模蛋白组定量研究中有很大优势.本综述主要介绍了这2类无标记定量方法的模型及优缺点,并比较了2类方法的灵敏度和准确度.肽段计数方法在检测蛋白丰度变化时更灵敏,而峰面积强度在评估蛋白比率时更准确.
作 者: 薛晓芳 吴松锋 朱云平 贺福初 XUE Xiao-Fang WU Song-Feng ZHU Yun-Ping HE Fu-Chu 作者单位: 军事医学科学院放射与辐射医学研究所,北京,100850 刊 名: 中国生物化学与分子生物学报 ISTIC PKU 英文刊名: CHINESE JOURNAL OF BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY 年,卷(期): 2006 22(6) 分类号: Q5 关键词: 无标记蛋白定量 质谱数 峰强度