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猪戊型肝炎病毒大庆株DQ1全基因序列分析

时间:2021-12-07 17:45:32 生物医学论文 我要投稿

猪戊型肝炎病毒大庆株DQ1全基因序列分析

本试验采用RT-PCR的方法对戊型肝炎病毒大庆株(DQ1HEV株)的全基因进行分片段扩增,并对其两个末端采用末端快速扩增法(RACE)进行扩增、克隆,测序.与已报道的人的14株HEV的4个基因型的核苷酸和氨基酸进行比较,与Ⅳ型HEV的同源性最高.ORF1区与Ⅳ型HEV核苷酸的同源性为82.6%~83.6%,氨基酸同源性为93.5%.ORF2区与Ⅳ型HEV核苷酸的同源性为87.0%~88.4%,氨基酸同源性为95.8%~97.4%.ORF3区与Ⅳ型HEV核苷酸的同源性为94.4%~96.5%,氨基酸同源性为90.3%~96.5%.其结果表明DQ1 HEV株为Ⅳ型HEV.

作 者: 于敏 曲娟娟 郭巍 赵立平 相文华 YU Min QU Juan-juan GUO Wei ZHAO Li-Ping XIANG Wen-Hua   作者单位: 于敏,YU Min(中国农业科学院哈尔滨兽医研究所,兽医生物技术国家重点实验室/大动物病研究室,黑龙江,哈尔滨,150001;东北农业大学,黑龙江,哈尔滨,150030)

曲娟娟,QU Juan-juan(东北农业大学,黑龙江,哈尔滨,150030)

郭巍,赵立平,相文华,GUO Wei,ZHAO Li-Ping,XIANG Wen-Hua(中国农业科学院哈尔滨兽医研究所,兽医生物技术国家重点实验室/大动物病研究室,黑龙江,哈尔滨,150001) 

刊 名: 中国预防兽医学报  ISTIC PKU 英文刊名: CHINESE JOURNAL OF PREVENTIVE VETERINARY MEDICINE  年,卷(期): 2006 28(5)  分类号: Q78 S852.65  关键词: 猪戊型肝炎病毒   克隆   序列分析