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洞庭青鲫与其他六个鲫鱼品系线粒体DNA控制区的比较分析

时间:2021-12-07 17:42:10 生物医学论文 我要投稿

洞庭青鲫与其他六个鲫鱼品系线粒体DNA控制区的比较分析

运用PCR扩增、克隆、测序等技术,在获得洞庭青鲫和彭泽鲫线粒体DNA控制区全序列的基础上,对洞庭青鲫、彭泽鲫、普通鲫、红鲫、白鲫、A系和D系银鲫等7个鲫鱼品系线粒体DNA控制区的碱基组成、变异情况、序列结构和系统进化进行了比较分析.结果表明,7个鲫鱼品系线粒体DNA控制区碱基的平均组成为A:(32.7±0.16)%,C:(20.4±0.37)%,G:(14.1±0.08)%,T:(32.8±0.36)%,序列分歧率为0-5.7%,其中红鲫和白鲫的分歧率最大(5.7%),彭泽鲫、A系和D系银鲫之间最小(0).洞庭青鲫与白鲫的分歧率为5.6%,与彭泽鲫、A系和D系银鲫为2.2%,与红鲫和普通鲫分别为0.8%和0.7%.对比哺乳动物线粒体DNA控制区结构,并参照其他鱼类序列,将7个鲫鱼品系的控制区分为终止序列区、中央保守区和保守序列区三个区域.同时识别了7个鲫鱼品系中一系列保守序列,并给出了它们的一般形式.序列差异和系统进化分析表明,在7个鲫鱼品系中,洞庭青鲫与普通鲫和红鲫的亲缘关系最近,与彭泽鲫、A系和D系银鲫亲缘关系次之,与白鲫的亲缘关系最远,而彭泽鲫、A系和D系银鲫三者在线粒体DNA控制区的相似性和分歧率上则表现为是同一个鲫鱼品系.

作 者: 刘良国 杨品红 王文彬 王晓艳 谢春华 李梦军 LIU Liang-Guo YANG Pin-Hong WANG Wen-Bin WANG Xiao-Yan XIE Chun-Hua LI Meng-Jun   作者单位: 刘良国,王文彬,LIU Liang-Guo,WANG Wen-Bin(湖南文理学院生命科学学院,常德,415000)

杨品红,YANG Pin-Hong(湖南文理学院生命科学学院,常德,415000;湖南省水产工程技术研究中心,常德,415000)

王晓艳,谢春华,李梦军,WANG Xiao-Yan,XIE Chun-Hua,LI Meng-Jun(湖南省水产工程技术研究中心,常德,415000) 

刊 名: 水生生物学报  ISTIC PKU 英文刊名: ACTA HYDROBIOLOGICA SINICA  年,卷(期): 2010 34(2)  分类号: Q347  关键词: 洞庭青鲫   鲫鱼品系   线粒体DNA   控制区   系统进化   Carassius auratus Dongtingking variety   Strains of Carassius auratus   Mitochondrial DNA   Control region   Phylogeny