高温环境样品总DNA直接和间接提取方法的比较
分别采用两种环境总DNA直接提取法和一种间接提取法从6种温泉菌席样品中提取总DNA,以DNA粗产物的纯度、能否用于后续PCR扩增及PCR-DGGE(变性梯度凝胶电泳)所反映的微生物多样性为评价指标对两类方法进行比较和评价.研究发现,虽然间接提取法效率低下,但对于高温极端环境中生物量较小的样品,间接法能得到有研究价值的、纯度较高的环境样品总DNA,而直接法得到的DNA量小且不适于PCR扩增操作.在使用这2类方法都能得到可用于研究操作的DNA的情况下,间接提取法能更好的体现环境样品中微生物的多样性.
作 者： 刘宏伟 彭谦 李沁元 肖炜 崔晓龙 林连兵 刘志坚 姜成林 徐丽华 陈义光 王治刚 任禛 邓岚 文孟良 作者单位： 刘宏伟,彭谦,肖炜,崔晓龙,刘志坚,姜成林,徐丽华,陈义光,王治刚,任禛,邓岚,文孟良(云南大学,云南省微生物研究所,云南省生物资源保护与利用重点实验室,昆明,650091)李沁元(云南大学生命科学教学实验中心,昆明,650091)
林连兵(昆明理工大学生物与化学工程学院,昆明,650224)
刊 名： 微生物学报 ISTIC PKU 英文刊名： ACTA MICROBIOLOGICA SINICA 年，卷(期)： 2006 46(6) 分类号： Q93 关键词： 菌席 环境DNA 间接DNA提取法 PCR-DGGE