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采用粒子群优化的基因转录差异分析模型

时间:2021-12-07 15:34:21 生物医学论文 我要投稿

采用粒子群优化的基因转录差异分析模型

高通测序技术可以更加全面地检测实验样本中基因转录水平,这使得对样本间基因转录差异的分析精度越来越准确.根据通过DNA高通测序技术获得的基因转录区内Pol Ⅱ蛋白个数,提出了两个样本间基因转录差异分析模型.该模型在考虑同一基因间转录差异的同时,引入了全基因的转录分布特性以提高模型分析精度.模型采用预测概率最大化统计算法进行参数求取.在概率最大化步骤中,由于难以得到模型参数解析解和提高算法效率,采用粒子群优化算法直接进行求取模型参数数值解.乳腺癌实验数据测试表明,该模型可有效分析不同样本间基因转录差异.

作 者: 冯伟兴 王科俊   作者单位: 哈尔滨工程大学模式识别与智能系统研究所,哈尔滨,150001  刊 名: 中国生物医学工程学报  ISTIC PKU 英文刊名: CHINESE JOURNAL OF BIOMEDICAL ENGINEERING  年,卷(期): 2010 29(2)  分类号: Q332  关键词: 基因   转录差异   粒子群   分析模型