支持向量机方法预测离子通道蛋白
讨论一种基于蛋白质结构域的方法预测离子通道蛋白.通过将蛋白质的结构域转化成为固定长度的向量,使用支持向量机方法进行离子通道蛋白的预测,并将预测结果与线性判别分析以及利用InterPro与GO映射规则进行预测的结果进行了比较.通过留一法交叉验证,取得最好的预测效果,敏感度为95.9%,专一性为98.3%.
作 者： 涂白 毕然 作者单位： 华中科技大学生命科学与技术学院,武汉,430074 刊 名： 计算机与数字工程 ISTIC 英文刊名： COMPUTER AND DIGITAL ENGINEERING 年，卷(期)： 2007 35(10) 分类号： Q816 关键词： 离子通道 结构域 支持向量机 基因本体