五种/株原甲藻核糖体小亚基(18S rRNA)基因克隆及序列分析
采用分子克隆及序列比对的方法,对五种/株赤潮原甲藻18S rRNA基因全长序列进行扩增、克隆和序列测定,并从GenBank上下载13个原甲藻18S rRNA基因接近全长的序列,用NJ法和ME法构建了原甲藻属的系统树.结果表明,五种/株原甲藻18S rRNA基因扩增序列长度为1782-1783bp,其中来自南海(中国海域)和来自美国海域的两株微小原甲藻(Prorocentrum minimum)的序列完全一致;东海的赤潮原甲藻(Prorocentrum sp.)与具齿原甲藻(P.dentatum)的序列也完全一致,与微小原甲藻只有5个碱基的差异;而海洋原甲藻(P.micans)与微小原甲藻和具齿原甲藻的序列差异较大,分别为27个和28个碱基.通过NJ法和ME法构建的系统树基本一致.由系统树可以看到:原甲藻属大致分为两支,本实验的微藻全部分布在同一支上.18S rRNA基因序列还将有助于有害赤潮藻快速鉴定的特异性分子探针的研制.
作 者： 王波 米铁柱 吕颂辉 孙军 李秀芹 甄毓 李荣秀 于志刚 WANG Bo MI Tie-Zhu L(U) Song-Hui SUN Jun LI Xiu-Qin ZHEN Yu LI Rong-Xiu YU Zhi-Gang 作者单位： 王波,米铁柱,李秀芹,甄毓,于志刚,WANG Bo,MI Tie-Zhu,LI Xiu-Qin,ZHEN Yu,YU Zhi-Gang(中国海洋大学,青岛,266003)吕颂辉,L(U) Song-Hui(暨南大学水生生物研究所,广州,510632)
孙军,SUN Jun(中国科学院海洋研究所,青岛,266071)
李荣秀,LI Rong-Xiu(上海交通大学,上海,200030)
刊 名： 海洋与湖沼 ISTIC PKU 英文刊名： OCEANOLOGIA ET LIMNOLOGIA SINICA 年，卷(期)： 2006 37(5) 分类号： Q93 关键词： 原甲藻属 18SrRNA基因 系统分析