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水稻单核苷酸多态性及其应用

时间:2021-12-07 15:23:09 生物医学论文 我要投稿

水稻单核苷酸多态性及其应用

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)在水稻中数量多,分布密度高,最高SNPs数量可达80 127个,每154个碱基就存在一个SNP,平均SNP频率为0.65%左右.SNPs水稻亚种内品种间也很丰富,亲缘关系近的品种(或品系)间,即使用其他传统的分子标记方法难以找到多态性位点,用SNPs标记法也能找到数量可观的多态性位点.水稻SNP频率在各染色体间存在显著差异,而且在每条染色体上的分布也不均匀,存在明显的SNPs富集区域和稀缺区域.水稻SNPs的发现方法主要有对样本DNA的PCR产物直接测序、从SSR区段检测SNPs,以及从基因组序列和EST数据库直接搜索等.目前已有多种基因分型(genotyping) 技术运用到了水稻SNPs检测,SNPs检测的高度自动化使水稻SNPs基因分型非常方便,SNPs检测还可以转化为CAPS(或dCAPS)标记或等位基因特异的PCR标记进行SNPs的基因分型.单核苷酸多态性在水稻遗传图谱的构建、基因克隆和功能基因组学研究、标记辅助选择育种、遗传资源分类及物种进化等方面的应用具有巨大潜力.

作 者: 刘传光 张桂权 LIU Chuan-Guang ZHANG Gui-Quan   作者单位: 刘传光,LIU Chuan-Guang(广东省农业科学院水稻所,广州,510640)

张桂权,ZHANG Gui-Quan(华南农业大学农学院,广州,510642) 

刊 名: 遗传  ISTIC PKU 英文刊名: HEREDITAS(BEIJING)  年,卷(期): 2006 28(6)  分类号: Q94  关键词: 单核苷酸多态性   水稻   基因分型   遗传育种