按蚊防御素基因家族转录模式和启动子的生物信息学分析
运用生物信息学方法分析冈比亚按蚊(Anopheles gambiae)中防御素基因家族的表达模式和启动子保守区.在ENSEMBL数据库中搜索防御素基因家族序列,然后将基因编号输入angaGEDUCI数据库中进行分析.结果在冈比亚按蚊中存在有4个防御素基因的异构体分子,其中DEF1基因表达模式与其它3个基因存在明显差异.4个防御素基因启动子序列都存在AP-1、CATA-1、CCN4、GR、HNF-3B、TFIID 6个转录因子的识别结合位点,表明这6个转录因子是冈比亚按蚊防御素基因家族表达调控所必需的.值得注意的是,DEF1基因启动子序列中存在与性别决有关的SOX proteins转录因子的结合位点.暗示DEF1基因的转录调控可能与性别分化有关;而在DEF2基因启动子序列中存在有热激因子(HSTF)的识别结合位点,表明热刺激会调控DEF2基因的表达.
吴建伟,WU Jian-wei(贵阳医学院寄生虫学教研室,贵州,贵阳,550004)
刊 名： 生物信息学 ISTIC 英文刊名： CHINA JOURNAL OF BIOINFORMATICS 年，卷(期)： 2008 6(3) 分类号： Q969.92 关键词： 防御素 冈比亚按蚊 转录模式 转录因子