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利用基因组文库加速Xa23基因定位的染色体步移
用距离水稻抗白叶枯病基因Xa23 0.8 cM的EST标记C189,扩增Xa23的近等基因系CBB23的基因组片段(0.8 kb)为探针,筛选水稻明恢63的TAC文库和广陆矮4号的PAC文库,对获得的7个阳性克隆用酶切法和Tail-PCR法进行末端片段分离,获得15个末端片段, 用于感病亲本金刚30和抗病亲本CBB23之间的多态性检测,发现7个末端片段在双亲间有多态性,分别为69B、70N、81N、45B、45N、84N和84B.用这些末端片段作RFLP标记,对金刚30/CBB23的F2群体进行检测和连锁分析,结果表明这些标记与Xa23的遗传距离依次为0.4、0.4、0.4、0.5、0.6、0.6和1.1 cM.虽然69B、70N和81N与Xa23的遗传距离均为0.4 cM,但序列比对揭示69B与70N的物理距离为35 kb,与81N为95 kb,69B距Xa23最近.三者与Xa23的遗传距离虽然相同,但物理距离存在很大差异.这些末端片段标记加密了Xa23基因一侧的遗传图谱,并使其遗传距离缩短到0.4 cM,加速了Xa23的定位进程,为Xa23的分离克隆奠定了重要基础.讨论了这种染色体步移方法的适用条件.
作 者: 王春连 陈乐天 曾超珍 张群宇 刘丕庆 刘耀光 樊颖伦 章琦 ZHAO Kai-jun 赵开军 作者单位: 刊 名: 中国水稻科学 ISTIC PKU 英文刊名: CHINESE JOURNAL OF RICE SCIENCE 年,卷(期): 2006 20(4) 分类号: Q943.2 S511.03 关键词: 水稻白叶枯病 抗性基因 基因定位 TAC文库 PAC文库 染色体步移【利用基因组文库加速Xa23基因定位的染色体步移】相关文章:
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