新疆细毛羊2倍基因组BAC文库PCR筛选系统的构建与使用
本研究所构建的BAC文库覆盖了8倍新疆细毛羊的基因组,平均插入片段的大小为133kb,同时文库92.5%的克隆插入片段大于100 kb,而且有部分克隆甚至大于300kb,假定绵羊的基因组含有3×106kb,根据文库的平均插入片段大小为133kb,从文库筛选到目的片段的概率为98.208%.为了验证文库有较好的覆盖率,构建了2倍基因组文库PCR筛选系统,并对位于新疆细毛羊20号染色体MHC基因邻近区段的DMB_EX2、MCMA36、CP73和BM1258 4个分子标记进行了筛选,得到的平均阳性克隆数为1.5个,从筛选结果来看,这与文库插入片段估计的8倍基因组覆盖率相当接近并且没有偏向,这使得本文库成为研究绵羊的功能基因、位置克隆和完善基因组物理图谱的极为有用的资源.
作 者： 李谨 杨公社 陈创夫 刘海波 马润林 王金富 LI Jin YANG Gong She CHEN Chuang Fu LIU Hai Bo MA Run Lin WANG Jin Fu 作者单位： 李谨,LI Jin(石河子大学动物科技学院,新疆,石河子,832003;西北农林科技大学动物科技学院,陕西,杨凌,712100)杨公社,YANG Gong She(西北农林科技大学动物科技学院,陕西,杨凌,712100)
陈创夫,王金富,CHEN Chuang Fu,WANG Jin Fu(石河子大学动物科技学院,新疆,石河子,832003)
刘海波,马润林,LIU Hai Bo,MA Run Lin(中国科学院遗传与发育研究所,北京,100101)
刊 名： 分子细胞生物学报 ISTIC PKU 英文刊名： JOURNAL OF MOLECULAR CELL BIOLOGY 年，卷(期)： 2006 39(6) 分类号： Q95 关键词： 新疆细毛羊 基因组 BAC文库 插入片段 PCR筛选系统