- 相关推荐
文蛤属(Meretrix)16S rRna基因及ITS1序列的系统学分析
利用线粒体16S rRNA基因片段及核糖体DNA转录间隔区ITS1序列分析的方法,以近缘属的青蛤(Cyclina sinensis)为外群,对文蛤属的文蛤(M.meretrix)、丽文蛤(M.lusoria)、帘文蛤(M.lyrata)和斧文蛤(M.lamarckii)4种贝类进行了系统学研究.经ClustalX多重比对及DNAsp软件分析后,用PAUP4.0分析软件,计算出种间序列的碱基转换/颠换频率,利用邻接法NJ构建系统发育树.结果表明,帘文蛤与该属其他三种的分歧时间较早,两类序列与其他种类间的相对遗传距离分别在0.25866-0.28218和0.15644-0.20104之间.文蛤与丽文蛤间的16S rDNA及ITS1序列间的遗传距离仅为0.04805和0.04201,拓扑结构图显示关系很近,并且二者的分布区大面积重叠,其序列间的转换/颠换频率接近种内单元型(haplotype)间的序列变化,鉴于它们的贝壳形态有一定差别,应归为同一个种内的不同地理亚种比较恰当.
作 者: 潘宝平 吴琪 张素萍 宋林生 卜文俊 PAN Bao-Ping WU Qi ZHANG Su-Ping SONG Lin-Sheng BU Wen-Jun 作者单位: 潘宝平,PAN Bao-Ping(天津师范大学化学与生命科学学院,天津,300074;南开大学生命科学学院,天津,300071)吴琪,WU Qi(天津师范大学化学与生命科学学院,天津,300074)
张素萍,宋林生,ZHANG Su-Ping,SONG Lin-Sheng(中国科学院海洋研究所,青岛,266071)
卜文俊,BU Wen-Jun(南开大学生命科学学院,天津,300071)
刊 名: 海洋与湖沼 ISTIC PKU 英文刊名: OCEANOLOGIA ET LIMNOLOGIA SINICA 年,卷(期): 2006 37(4) 分类号: Q95 关键词: 文蛤属 文蛤 丽文蛤 16S rRNA基因 ITS1 分子系统学【文蛤属(Meretrix)16S rRna基因及ITS1序列的系统学分析】相关文章:
16S rRNA基因序列分析在非典型菌株鉴定中的应用04-26
温氏附红细胞体部分16S rRNA基因的序列测定和分析04-26
条斑星鲽和圆斑星鲽线粒体12S rRNA与16S rRNA基因序列及其系统分析04-30
16S rRNA基因及外膜蛋白基因分析在鸭疫里默氏菌鉴定中的应用04-27
甘蓝MLPK基因的克隆与序列分析04-27
中国李PGIP基因的克隆及序列分析04-28
基于12S rRNA基因序列探讨崇安地蜥的分类地位04-26
人溶菌酶基因cDNA的克隆和序列分析04-26
甜瓜抗霜霉病基因同源序列克隆与分析04-27
白花柽柳质膜水孔蛋白基因克隆及序列分析04-29