一个基于Blast程序的多重序列对齐程序--Mblast
核酸序列和蛋白质序列的相似性分析日益成为生物信息学研究的核心内容.NCBI的Blast程序是进行此类分析的最有力工具.虽然它提供了初步的将多条序列进行综合对齐的分析方案,但是实际效果却很不理想.在对Blast程序的输出结果进行仔细分析的基础上,基于"求同存异”的思想,我们编制了一个多重序列对齐程序Mblast.该程序与目前流行的序列多重对齐程序相比,更容易检出序列的同源区.
作 者: 孙焕东 张成岗 贺福初 作者单位: 孙焕东(军事医学科学院医学信息研究所,)张成岗,贺福初(军事医学科学院放射医学研究所,)
刊 名: 生物化学与生物物理进展 ISTIC SCI PKU 英文刊名: PROGERSS IN BILCHEMISTRY AND BIOPHYSICS 年,卷(期): 2001 28(3) 分类号: Q61 关键词: Blast程序 序列多重对齐