植物查尔酮异构酶的生物信息学分析

植物查尔酮异构酶的生物信息学分析

采用生物信息学方法和工具对GenBank中的洋葱、豌豆、番茄和茶等植物的黄酮类化合物合成关键酶查尔酮异构酶(CHI)的核酸和氨基酸序列进行了比对、分析和建模,进而对其分子结构、理化性质、亚细胞定位、蛋白转运肽、跨膜结构域、疏水性、分子系统进化、蛋白质二级和三级结构等重要参数进行了预测和推理.结果表明:该类酶基因的全长包括5'、3'非翻译区和一个开放阅读框,无蛋白转运肽,且定位于细胞质基质,是一个疏水性蛋白,二级结构均以随机卷曲和α-螺旋为主要构件,洋葱和豌豆的CHI三维建模成功.

作 者： 雷桅 邹祥 向阳 汤绍虎 孙敏 LEI Wei ZOU Xiang XIANG Yang TANG Shao-hu SUN Min   作者单位： 雷桅,向阳,汤绍虎,孙敏,LEI Wei,XIANG Yang,TANG Shao-hu,SUN Min(西南大学,生命科学学院,三峡库区生态环境教育部重点实验室,重庆,400715)

邹祥,ZOU Xiang(西南大学药学院,重庆,400715) 

刊 名： 北方园艺  PKU 英文刊名： NORTHERN HORTICULTURE  年，卷(期)： 2008 ""(2)  分类号： Q946.5 Q558  关键词： 查尔酮异构酶   生物信息学   黄酮类化合物  

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