RS/6000机群系统中分子动力学并行算法的研究

RS/6000机群系统中分子动力学并行算法的研究

在IBM RS/6000工作站组成的机群系统和PVM(并行虚拟机)并行环境中,用消息传递机制方式和C++语言实现了微正则系综(NVE)的分子动力学并行计算程序,并对不同分子数(256～108000)组成的Lennard-Jones理想流体进行了模拟研究.结果表明,在小型机群系统中,原子分解法具有理想的加速比,考虑到区域分解法的适用范围有限且实现困难,因此认为原子分解法是小型机群系统进行分子动力学并行模拟计算的理想选择.

作 者： 吴江涛 刘志刚 董小社 何戈   作者单位： 吴江涛,刘志刚(西安交通大学能源与动力工程学院,陕西,西安,710049)

董小社,何戈(西安交通大学新型计算机研究所,陕西,西安,710049) 

刊 名： 工程热物理学报  ISTIC EI PKU 英文刊名： JOURNAL OF ENGINEERING THERMOPHYSICS  年，卷(期)： 2002 23(4)  分类号： O552.3 O641.3  关键词： 并行分子动力学   机群系统   微正则系综   PVM并行环境  

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