青藏高原三江源地区高寒草甸土反硝化细菌多样性的初步研究
应用PCR-RFLP和测序分析首次对青藏高原腹地三江源自然保护区高寒草甸土壤反硝化细菌基因(nirK和nosZ)的多样性和系统发育进行了探讨.研究选用了4个海拔在4600 m以上的高寒草甸样地,主成分分析表明样地间具有不同的理化性状.经过PCR-RFLP分析,在4个样品中分别获得253个nirK基因克隆和283个nosZ基因克隆,其中nirK基因具有78个可操作分类单元(OTUs),nosZ基因具有120个OTUs.环境因子分析表明,海拔高度和土壤C/N比可能是影响土壤反硝化细菌的重要因素.本研究还选取了36个nirK克隆和17个nosZ克隆进行部分基因测序分析,DNAMAN比较表明,nirK和nosZ基因序列间分别具有69%~98%和57%~97%的相似性.在系统发育树中,序列都可以分为4个不同的簇,部分测定的基因序列与属于Proteobacteria的3个系统发育亚簇(α,β和γ)的已知反硝化细菌具有一定的亲缘关系,另外一些序列与非培养细菌具有较近的亲缘关系.
李迪强(中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所,国家林业局森林生态环境重点实验室,北京,100091)
王慧敏,肖启明,刘学端(湖南农业大学生物安全科技学院,长沙,410128)
刊 名： 科学通报 ISTIC PKU 英文刊名： CHINESE SCIENCE BULLETIN 年，卷(期)： 2006 51(6) 分类号： P5 关键词： 高寒草甸 反硝化细菌 nirK nosZ 多样性