将硬盘正常分区格式化，再将两块硬盘都接到系统中，就会发生盘符错乱的问题，此时就会发现：第一个硬盘的主分区还是C，而D盘变成了第二块硬盘的主分区，由于D盘符被占用，因此主硬盘的各个逻辑分区只能依次向后排列，变成E、F、G……这是因为DOS及Windows 9x对磁盘管理方式的缺陷造成的，
双硬盘的盘符错乱问题
。要解决这种问题，可以使用下列方法：（1）禁用BIOS设置。如果计算机使用的是Windows 98操作系统，只要在BIOS中将第二块硬盘的参数设置为NONE，这样在进入Windows以后就会自动检测到第二块硬盘，并会自动将第二块硬盘的盘符依次向后排列，从而解决了盘符混乱的问题。
不过这种方法只能在Windows中使用，在DOS状态下看不到第二块硬盘的各个分区；而且，由于在启动时不会检测第二块硬盘，所以该硬盘不能作为系统盘启动，
电脑资料
《双硬盘的盘符错乱问题》(https://www.unjs.com)。（2）在Windows 2000/XP/2003中更改盘符。如果计算机中安装的是Windows 2000/XP/2003等操作系统，也可以在Windows中用鼠标右键单击“我的电脑”图标，选择快捷菜单中的“管理”命令打开“计算机管理”窗口，再单击“磁盘管理”，可以为各个分区更改盘符，这样也可以解决盘符排列错乱的问题。
（3）不激活主分区。由于只有第二块硬盘的主分区被激活以后，才会排列在第一块硬盘主分区的后面，所以，如果不激活第二块硬盘的主分区，则无论在DOS下还是在Windows下，第二块硬盘的盘符都会自动排列在第一块硬盘的后面，这样也可以解决盘符混乱的问题。
但是，如果第二块硬盘的主分区已被激活，则可以利用Partition Magic、Disk Genius、Gdisk等工具将主分区转换成逻辑分区，这样第二块硬盘的各个分区盘符就会自动排列在第一块硬盘之后，不会再出现盘符错乱的情况。