3种水产病原弧菌(Vibrio)的16S-23S rDNA间区(IGSs)的克隆、测序与分析
根据细菌16S rDNA 3?端和23S rDNA 5?端的高度保守区设计引物,PCR扩增了5株溶藻弧菌、2株河流弧菌和2株创伤弧菌的16S-23S rDNA间区,克隆到pGEM-T载体上,测序; 采用BLAST和 DNAstar软件对16S-23S rDNA间区序列及其内的tRNA基因进行比较分析研究.结果表明,3种弧菌共测出的16S-23S rDNA间区有33条,类型有6种:IGS GLAV、IGS GLV、IGS IA、IGS G、IGS A和IGS 0,其中IGS IA和IGS G最为常见,9株弧菌均包含有此两类IGS;在3种弧菌中,大部分IGS序列tRNA基因两端的非编码区具有较高的种内同源性,可以成为设计种特异性引物和探针的靶区.16S-23S rDNA间区结构的差异为建立一类新的弧菌检测方法奠定了基础.溶藻弧菌的16S-23S rDNA间区序列为首次报道.
作 者： 邓先余 王智学 孙成波 何建国 DENG Xian-Yu WANG Zhi-Xue SUN Chen-Bo HE Jian-Guo 作者单位： 邓先余,DENG Xian-Yu(湖南科技大学生命科学学院,湘潭,411201;中国科学院海洋研究所,青岛,266071;中山大学生命科学学院,广州,510275)王智学,何建国,WANG Zhi-Xue,HE Jian-Guo(中山大学生命科学学院,广州,510275)
孙成波,SUN Chen-Bo(湛江海洋大学水产学院,湛江,524025)
刊 名： 海洋与湖沼 ISTIC PKU 英文刊名： OCEANOLOGIA ET LIMNOLOGIA SINICA 年，卷(期)： 2006 37(2) 分类号： Q346 关键词： 溶藻弧菌 河流弧菌 创伤弧菌 16S-23S rDNA间区 tRNA基因