Fas基因mRNA反义靶点筛选和体外验证
应用PARASS(poly-A anchored RNA accessible sites screening)技术筛选Fas基因mRNA获得3个潜在反义作用靶点,靶点1、2、3分别位于Fas基因297nt~317nt、619nt~639nt和662nt-682nt.设计了对应靶点的反义寡核苷酸A1、A2、A3和10-23型DNAzyme D1、D2和D3.将反义寡核苷酸和Fas基因RNA结合再加入RNase H进行反应,10-23型DNAzyme则直接与Fas基因RNA作用,结果表明:3个靶点的反义寡核苷酸组及DNAzyme均能降解Fas基因RNA,为有效靶点,其靶点反应优势次序为靶点3>靶点1>靶点2.而非靶点对照组和有效靶点突变了2个碱基的对照组均没有反应.靶点2和靶点3与ISIS公司经过多次实验筛选到的Fas反义作用靶点位置基本相同,表明PARASS技术的有效性和可靠性.获得的有效反义寡核苷酸和DNAzyme为后续研究打下基础.
作 者: 左刚 韩慧明 田晓丽 王全会 毛建平 ZUO Gang HAN Hui-ming TIAN Xiao-li WANG Quan-hui MAO Jian-ping 作者单位: 左刚,韩慧明,王全会,毛建平,ZUO Gang,HAN Hui-ming,WANG Quan-hui,MAO Jian-ping(军事医学科学院放射与辐射医学研究所,北京,100850)田晓丽,TIAN Xiao-li(军事医学科学院附属307医院,北京,100850)
刊 名: 中国生物工程杂志 ISTIC PKU 英文刊名: CHINA BIOTECHNOLOGY 年,卷(期): 2006 26(4) 分类号: Q756 关键词: 靶点 反义寡核苷酸 DNAzyme Fas PARASS