简并引物的程序化设计与荔枝HMGR基因片段的克隆
主要介绍了利用NCBI、DDBJ、Blockmaker、CodeHop和Oligo 6.0等数据库和生物软件进行简并引物设计的方法.利用设计的6对简并引物进行RT-PCR,从荔枝(Litchi chinensis Sonn.)果实中克隆到2个长度分别为510 bp和582 bp的cDNA片段.通过Blastx检索Genbank进行同源性比对后,发现2片段都与其它植物的HMGR基因具有较高的氨基酸序列同源性.研究表明,该程序化设计的简并引物可信性强,阳性率高,能迅速得到满意结果.
作 者: 夏瑞 陆旺金 李建国 杜娟 XIA Rui LU Wang-jin LI Jian-guo DU Juan 作者单位: 夏瑞,李建国,杜娟,XIA Rui,LI Jian-guo,DU Juan(华南农业大学中国荔枝研究中心,广州,510642)陆旺金,LU Wang-jin(广东省果蔬保鲜重点实验室,广州,510642)
刊 名: 果树学报 ISTIC PKU 英文刊名: JOURNAL OF FRUIT SCIENCE 年,卷(期): 2006 23(6) 分类号: S667.1 关键词: 荔枝 间并引物 程序化设计 HMGR基因 克隆