简并引物的程序化设计与荔枝HMGR基因片段的克隆

简并引物的程序化设计与荔枝HMGR基因片段的克隆

主要介绍了利用NCBI、DDBJ、Blockmaker、CodeHop和Oligo 6.0等数据库和生物软件进行简并引物设计的方法.利用设计的6对简并引物进行RT-PCR,从荔枝(Litchi chinensis Sonn.)果实中克隆到2个长度分别为510 bp和582 bp的cDNA片段.通过Blastx检索Genbank进行同源性比对后,发现2片段都与其它植物的HMGR基因具有较高的氨基酸序列同源性.研究表明,该程序化设计的简并引物可信性强,阳性率高,能迅速得到满意结果.

作 者： 夏瑞 陆旺金 李建国 杜娟 XIA Rui LU Wang-jin LI Jian-guo DU Juan   作者单位： 夏瑞,李建国,杜娟,XIA Rui,LI Jian-guo,DU Juan(华南农业大学中国荔枝研究中心,广州,510642)

陆旺金,LU Wang-jin(广东省果蔬保鲜重点实验室,广州,510642) 

刊 名： 果树学报  ISTIC PKU 英文刊名： JOURNAL OF FRUIT SCIENCE  年，卷(期)： 2006 23(6)  分类号： S667.1  关键词： 荔枝   间并引物   程序化设计   HMGR基因   克隆  

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