大白菜苹果酸脱氢酶基因的克隆及序列分析
首先以一个用cDNA-AFLP分析大白菜[Brassica campestris L.ssp.pekinensis(Lour.)Olsson]雄性不育花蕾败育得到的差异表达片段(TDF,Transcript Derived Fragments)EST54-1为信息探针,在Gen-Bank数据库中进行同源EST序列检索,并对亲缘关系近的同源EST序列进行拼接,获得长度为1 574 bp的虚拟序列.然后设计引物,经RT-PCR扩增、测序,获得丫大白菜苹果酸脱氢酶基因的cDNA全长序列,并已将其登录到GenBank,登录号:FJ208590,该cDNA全长1 209 bp,编码403个氨基酸.同源分析显示该cDNA与电子克隆获得的核酸序列99%同源,该cDNA序列推导的氨基酸序列与拟南芥苹果酸脱氢酶同源性100%.虽然在大白菜花蕾败育过程中苹果酸脱氢酶基因mRNA表达量下降,但其与大白菜花蕾败育的关系还需通过RNA干扰等技术进行验证.
张鲁刚,ZHANG Lu-gang(西北农林科技大学园艺学院,陕西,杨凌,712100)
刊 名： 园艺学报 ISTIC PKU 英文刊名： ACTA HORTICULTURAE SINICA 年，卷(期)： 2009 36(3) 分类号： S634.1 关键词： 大白菜 花蕾败育 电子克隆 RT-PCR 苹果酸脱氢酶