Λ-、Δ-[Rh(bpy)2chrysi]3+对含C:T错配的DNA序列

Λ-、Δ-[Rh(bpy)2chrysi]3+对含C:T错配的DNA序列识别作用的分子模拟研究

通过分子模拟方法研究了手性金属配合物[Rh (bpy)2Chrysi]3+ ( bpy=2,2'-bipyridine; Chrysi= 5,6- chrysenequinonediimine )对包含C:T 错配碱基对的B-DNA序列的识别作用.结合类似的针对含G:A错配的和正常的B-DNA序列的识别作用研究,发现配合物[Rh (bpy)2Chrysi]3+可以对错配B-DNA序列进行序列特异性的识别.能量对比计算结果表明,该经典插入识别作用倾向于在错配碱基对附近进行,其中Δ - [Rh(bpy)2chrysi]3+比其手性异构体更占优势.这同Barton教授工作组的实验结果是一致的.另外插入作用倾向于在错配序列中的正常双碱基对C3A4/G3T4(错配碱基对附近)中从小沟进行.与该配合物对含G:A错配的和正常的B-DNA序列的识别作用不同的是,对包含C:T 错配碱基对的B-DNA序列的识别作用倾向于从小沟进行.这一点可能源于C:T碱基对结构的不同.

作 者： 熊振海 杨频 XIONG Zhen-hai YANG Pin   作者单位： 熊振海,XIONG Zhen-hai(山西大学分子科学研究所,分子生物学和分子工程教育部重点实验室,山西,太原,030006;上海交通大学化学化工学院,上海,200240)

杨频,YANG Pin(山西大学分子科学研究所,分子生物学和分子工程教育部重点实验室,山西,太原,030006) 

刊 名： 分子科学学报  ISTIC PKU 英文刊名： JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCE  年，卷(期)： 2006 22(3)  分类号： Q52  关键词： 分子模拟   ESFF   C:T错配DNA   金属配合物