辽宁碱蓬甜菜碱醛脱氢酶基因(BADH)启动子分离及序列分析
根据已知的辽宁碱蓬BADH cDNA 5'端序列设计两个基因特异的反向引物(BR1,BR2),通过衔接头PCR获得了BADH基因起始密码子上游265 bp的序列.根据所获得的序列设计两个基因特异的反向引物(BR3,BR4),用BR2、BR3、BR4分别与4个简并引物配对,通过TAIL-PCR扩增,获得了约2kb的序列.经Sequencer软件拼接上述两段序列,获得了BADH基因起始密码子上游2055 bp的序列.用TSSP-TCM软件分析此序列,预测出转录起始点(T)位于起始密码子上游62 bp处,由此获得了1993 bp的SlBADH启动子序列.用PLACE软件分析此序列,发现该序列具有启动子的基本元件TATA-box、CAAT-box,包含多个胁迫诱导元件,如盐诱导元件GAAAAA,抗冻、缺水、脱落酸、抗寒元件CANNTG,伤害诱导元件ANATFNCNN,热激元件ATAAATGT等,是一个强的胁迫诱导启动子.
作 者： 李秋莉 张毅 尹辉 李丹 LI Qiu-Li ZHANG Yi YIN Hui LI Dan 作者单位： 辽宁师范大学生命科学学院,大连,116029 刊 名： 生物工程学报 ISTIC PKU 英文刊名： CHINESE JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 年，卷(期)： 2006 22(1) 分类号： Q781 关键词： 辽宁碱蓬 甜菜碱醛脱氢酶 启动子 序列分析