基于小波分析的蛋白质序列分形研究

基于小波分析的蛋白质序列分形研究

利用氨基酸的疏水自由能对蛋白质序列进行编码,选择墨西哥帽小波对于编码序列进行多尺度分解,应用基于小波分解的Abry-Veitch算法来研究蛋白质一级结构的分形特性,最后通过计算Hurst指数来定量刻画蛋白质序列的自相似性.实验结果表明.本文的方法只依据蛋白质一级序列的信息,可获得反映了蛋白质序列排列的自相似性和复杂度一个判据,相比于其他方法,本文的方法简单、可靠,为蛋白质序列的分析和研究提供了一个新的思路.

作 者： 汤丽华   作者单位： 南京邮电大学地理与生物信息学院,江苏,南京,210003  刊 名： 科技信息  英文刊名： SCIENCE & TECHNOLOGY INFORMATION  年，卷(期)： 2009 ""(33)  分类号： Q5  关键词： Abry-Veitch算法   Hurst指数   墨西哥帽小波   分形  

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