氧化亚铁钩端螺旋菌的固氮供硫蛋白与底物的相互作用
氧化亚铁钩端螺旋菌的nifS基因可能在它的固氮酶成熟中发挥重要的作用.为了考察由这个基因编码的蛋白质,建立了一个关于它的可靠的完整三维分子结构.建立的结构被进一步进行绑定位点搜索,跟辅因子磷酸吡哆醛(PLP)和底物半胱氨酸进行柔性分子对接,并据此识别其关键残基.在跟半胱氨酸对接中,半胱氨酸中的氨基非常靠近His102,Lys204和PLP,半胱氨酸跟它们的相互作用能也很大,这些情况跟那些来自其他生物的固氮供硫蛋白(NifS)类似物的实验事实一致.根据这些结果,这个基因编码NifS;底物半胱氨酸能被有效地募集到激活位点.
作 者： 刘元东 刘楚干 李琳 邹俐宏 刘学端 邱冠周 LIU Yuan-dong LIU Chu-gan LI Lin ZOU Li-heng LIE Xue-duan QIU Guan-zhou 作者单位： 刘元东,邹俐宏,刘学端,邱冠周,LIU Yuan-dong,ZOU Li-heng,LIE Xue-duan,QIU Guan-zhou(中南大学资源加工与生物工程学院,中国长沙,410083)刘楚干,LIU Chu-gan(湖南省新宁县崀山镇中心小学,中国邵阳,422702)
李琳,LI Lin(中南林业科技大学电子与信息工程学院,中国长沙,410004)
刊 名： 湖南师范大学自然科学学报 ISTIC PKU 英文刊名： JOURNAL OF NATURAL SCIENCE OF HUNAN NORMAL UNIVERSITY 年，卷(期)： 2008 31(3) 分类号： O726 关键词： 固氮供硫蛋白(NifS) 氧化亚铁钩端螺旋菌 同源建模 分子动力学 分子对接 磷酸吡哆醛(PLP) 半胱氨酸