东北林蛙皮肤中一类新抗菌肽cDNA的克隆及成熟肽的预测
为进一步研究和开发高效广谱天然抗生素的抗菌肽,本文克隆东北林蛙(Rana dybowskii)的抗菌肽基因,并预测其成熟肽的有关性质.根据蛙属抗茵肽信号肽末端序列设计简并引物,以RT-PCR技术扩增皮肤中抗菌肽的cDNA,并进行克隆测序.用生物信息学软件分析cDNA序列特点,预测成熟肽的理化性质.研究发现一种长度为28个氨基酸残基的新抗茵肽dybowsin-1,该肽具有Rana box结构;与已发现的抗茵肽仅有35%的同源性;理论等电点在9.70-10.01之间;均呈阳离子性;从第3或4个氨基酸开始到第16个氨基酸形成α-螺旋结构,极性氨基酸位于螺旋轮的一侧,非极性氨基酸位于螺旋轮的另一侧;具有N-端疏水、C-端亲水的两亲性.一个个体表达5条cDNA序列编码3种不同的dybowsin-1分子,显示出该抗菌肽表达的多样性.序列分析显示,该抗茵肽可能由多基因座位编码.
作 者： 朱倩 徐艳春 肖向红 ZHU Qian XU Yan-chun XIAO Xiang-hong 作者单位： 朱倩,徐艳春,ZHU Qian,XU Yan-chun(东北林业大学野生动物资源学院,黑龙江,哈尔滨,150040;国家林业局野生动植物检测中心,黑龙江,哈尔滨,150040)肖向红,XIAO Xiang-hong(东北林业大学野生动物资源学院,黑龙江,哈尔滨,150040)
刊 名： 现代生物医学进展 ISTIC 英文刊名： PROGRESS IN MODERN BIOMEDICINE 年，卷(期)： 2007 7(7) 分类号： Q78 关键词： 东北林蛙 Rana dybowskii 抗茵肽 cDNA 预测