粘质沙雷氏菌几丁质酶(ChiC)基因克隆及其生物信息学分析
从粘质沙雷氏菌(Serratia marcescens ATCC14041)中克隆出几丁质酶基因(ChiC),将回收纯化的PCR产物与载体pMD18-T连接,构建成的重组质粒命名为pMD-ChiC,将重组质粒转化到受体E.coli DH5α中进行克隆,经BamHⅠ和Nhe Ⅰ双酶切验证、核酸序列测定证实,重组质粒pMD-ChiC含有几丁质酶C基因(ChiC).利用生物信息学的方法,推测该粘质沙雷氏菌ChiC基因编码的蛋白质由480个氨基酸组成.预测该蛋白的等电点为5.63,分子量约为52kD.针对粘质沙雷氏菌中的几个几丁质酶基因做了进化树,进而验证了粘质沙雷氏菌(Serratia marcescens)几丁质酶(ChiC)在沙雷氏菌几丁质酶中的分类;同时对粘质沙雷氏菌几丁质酶C(ChiC)蛋白的高级结构作出了预测,得到其编码的属于18家族的蛋白质高级结构图谱.
作 者: 魏巍 贺淹才 方柏山 刘爱花 WEI Wei HE Yan-cai FANG Bai-shan LIU Ai-hua 作者单位: 华侨大学,生物工程系,福建,泉州,362021 刊 名: 江西农业大学学报 ISTIC PKU 英文刊名: ACTA AGRICULTURAE UNIVERSITATIS JIANGXIENSIS 年,卷(期): 2006 28(3) 分类号: Q813.2 关键词: 几丁质酶ChiC基因 粘质沙雷氏菌 基因克隆 生物信息学分析