河豚白介素2基因鉴定及其生物信息学分析

河豚白介素2基因鉴定及其生物信息学分析

利用比较基因组学方法,在河豚(Fugu rubripes)基因组中鉴定了IL-2基因(FrIL-2).该基因为单拷贝基因,其结构、染色体定位均和人等高等动物一致,但基因非常精简.基因上游调控区含众多转录因子结合位点,3'UTR含poly(A)加尾信号和8个细胞因子类普遍存在的转录不稳定序列;FrIL-2基因编码149个氨基酸,N端含22个氨基酸组成的信号肽,肽链内含8个Cys,其中和生物学活性相关的Cys-66和Cys-116高度保守,在结构上存在一个类似IL-2特征性功能域结构,此外还存在一些修饰位点如N-糖基化位点和N端酰基化位点.比较河豚与人、哺乳动物、鸟类等IL-2的同源性,其氨基酸序列相似性为25%～34%.研究结果为今后利用鱼类基因组数据库和生物信息学快速鉴定新的鱼类功能基因打下了方法学基础,也为进一步开展鱼类IL-2基因功能研究提供了科学依据.

作 者： 董伟仁 邵健忠 项黎新 DONG Wei-ren SHAO Jian-zhong XIANG Li-xin   作者单位： 浙江大学,生命科学学院,浙江,杭州,310012  刊 名： 浙江大学学报（理学版）  ISTIC PKU 英文刊名： JOURNAL OF ZHEJIANG UNIVERSITY (SCIENCE EDITION)  年，卷(期)： 2006 33(6)  分类号： Q952.5  关键词： 河豚   IL-2基因   鉴定   比较基因组学  

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