穿龙薯蓣、黄山药和盾叶薯蓣psbA-trnH片段序列分析
为研究薯蓣叶绿体psbA-trnH片段遗传多样性,探讨该片段用于中药穿龙薯蓣、黄山药和盾叶薯蓣种间分子鉴别和系统学研究中的意义,我们对不同类群薯蓣种的叶绿体psbA-trnH基因间区进行PCR扩增并测序,获得了该区间的完整序列,所得序列用软件MEGA3.0进行相关分析.穿龙薯蓣的psbA-trnH片段全长274 bp,黄山药全长279 bp,盾叶薯蓣植物个体内的叶绿体DNA则有两种psbA-trnH片段,长度分别为241 bp和503 bp.经MEGA3.0软件分析, 3种薯蓣种间psbA-trnH片段序列的遗传距离(p-distance)为0.003 50～0.045 45,各个薯蓣种内的不同类群该序列无差异.用UPGMA法根据psbA-trnH序列的遗传距离建立系统发生树,聚类结果和形态分类相符.所得结果显示, psbA-trnH片段序列在所研究的3种薯蓣种内保守,在种间具有明显的较大差异,而3种薯蓣及薯蓣属的系统发生关系尚须进一步研究. 图3 表2 参6
邹文俊,邓思杨,ZOU Wenjun,DENG Siyang(成都地奥集团,成都,610041)
刊 名： 应用与环境生物学报 ISTIC PKU 英文刊名： CHINESE JOURNAL OF APPLIED & ENVIRONMENTAL BIOLOGY 年，卷(期)： 2006 12(6) 分类号： Q94 关键词： 薯蓣 psbA-trnH序列 序列分析