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短链蝎毒素BmK38的1H-NMR谱峰归属、二级结构分析及溶液构象

时间:2021-12-07 15:41:06 生物医学论文 我要投稿

短链蝎毒素BmK38的1H-NMR谱峰归属、二级结构分析及溶液构象

BmK38是最近从东亚钳蝎(Buthus martensi Karsch,BmK)中分离纯化得到的一种短链蝎毒素.应用2D-NMR技术研究 BmK38的溶液构象,通过分析其在水溶液中的DQF-COSY、TOCSY和NOESY等1H-NMR谱,识别了 BmK38全部40个氨基酸残基的自旋体系,并通过分析NOESY谱图中daN、dNN、dβN的联系,完成了序列专一性谱峰归属,标定了全部主链质子和绝大部分侧链质子的化学位移.根据谱峰归属的结果和NMR数据分析了 BmK38的二级结构组成并且计算出 BmK38的溶液构象.结构计算的结果与前述二级结构的分析是一致的.结果表明,肽段Gln8~Arg17形成 a 螺旋,而肽段Gly22~Glu29以及Leu32~CYS39构成反平行的β折叠,属于典型的短链蝎毒素的折叠形式.通过与其他 a-KTx短链蝎毒素的结构比较,讨论了 BmK38的结构特异性以及结构功能的相互关系.

作 者:   作者单位:   刊 名: 中国科学技术大学学报  ISTIC PKU 英文刊名: JOURNAL OF UNIVERSITY OF SCIENCE AND TECHNOLOGY OF CHINA  年,卷(期): 2006 36(7)  分类号: Q71  关键词: 短链蝎毒素   二维核磁共振   序列专一性归属   二级结构   溶液构象